En savoir plus

Notre utilisation de cookies

« Cookies » désigne un ensemble d’informations déposées dans le terminal de l’utilisateur lorsque celui-ci navigue sur un site web. Il s’agit d’un fichier contenant notamment un identifiant sous forme de numéro, le nom du serveur qui l’a déposé et éventuellement une date d’expiration. Grâce aux cookies, des informations sur votre visite, notamment votre langue de prédilection et d'autres paramètres, sont enregistrées sur le site web. Cela peut faciliter votre visite suivante sur ce site et renforcer l'utilité de ce dernier pour vous.

Afin d’améliorer votre expérience, nous utilisons des cookies pour conserver certaines informations de connexion et fournir une navigation sûre, collecter des statistiques en vue d’optimiser les fonctionnalités du site. Afin de voir précisément tous les cookies que nous utilisons, nous vous invitons à télécharger « Ghostery », une extension gratuite pour navigateurs permettant de les détecter et, dans certains cas, de les bloquer.

Ghostery est disponible gratuitement à cette adresse : https://www.ghostery.com/fr/products/

Vous pouvez également consulter le site de la CNIL afin d’apprendre à paramétrer votre navigateur pour contrôler les dépôts de cookies sur votre terminal.

S’agissant des cookies publicitaires déposés par des tiers, vous pouvez également vous connecter au site http://www.youronlinechoices.com/fr/controler-ses-cookies/, proposé par les professionnels de la publicité digitale regroupés au sein de l’association européenne EDAA (European Digital Advertising Alliance). Vous pourrez ainsi refuser ou accepter les cookies utilisés par les adhérents de l'EDAA.

Il est par ailleurs possible de s’opposer à certains cookies tiers directement auprès des éditeurs :

Catégorie de cookie

Moyens de désactivation

Cookies analytiques et de performance

Realytics
Google Analytics
Spoteffects
Optimizely

Cookies de ciblage ou publicitaires

DoubleClick
Mediarithmics

Les différents types de cookies pouvant être utilisés sur nos sites internet sont les suivants :

Cookies obligatoires

Cookies fonctionnels

Cookies sociaux et publicitaires

Ces cookies sont nécessaires au bon fonctionnement du site, ils ne peuvent pas être désactivés. Ils nous sont utiles pour vous fournir une connexion sécuritaire et assurer la disponibilité a minima de notre site internet.

Ces cookies nous permettent d’analyser l’utilisation du site afin de pouvoir en mesurer et en améliorer la performance. Ils nous permettent par exemple de conserver vos informations de connexion et d’afficher de façon plus cohérente les différents modules de notre site.

Ces cookies sont utilisés par des agences de publicité (par exemple Google) et par des réseaux sociaux (par exemple LinkedIn et Facebook) et autorisent notamment le partage des pages sur les réseaux sociaux, la publication de commentaires, la diffusion (sur notre site ou non) de publicités adaptées à vos centres d’intérêt.

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit des cookies sessions CAS et PHP et du cookie New Relic pour le monitoring (IP, délais de réponse).

Ces cookies sont supprimés à la fin de la session (déconnexion ou fermeture du navigateur)

Sur nos CMS EZPublish, il s’agit du cookie XiTi pour la mesure d’audience. La société AT Internet est notre sous-traitant et conserve les informations (IP, date et heure de connexion, durée de connexion, pages consultées) 6 mois.

Sur nos CMS EZPublish, il n’y a pas de cookie de ce type.

Pour obtenir plus d’informations concernant les cookies que nous utilisons, vous pouvez vous adresser au Déléguée Informatique et Libertés de l’INRA par email à cil-dpo@inra.fr ou par courrier à :

INRA
24, chemin de Borde Rouge –Auzeville – CS52627
31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

Menu Logo Principal logos partenaires

MASTER Sciences du Végétal

Génomique des espèces cultivées et bioinformatique

Parcours Sciences du Végétal

UPSaclay UParis

UE commune Université Paris-Saclay et Université de Paris

Responsables

Bénédicte STURBOIS (Université d'Évry - Université Paris-Saclay), Nathalie BOUDET (Université d'Évry - Université Paris-Saclay) et Karine ALIX (AgroParisTech - Université Paris-Saclay).

Contenu

L’UE « Génomique des espèces cultivées et bioinformatique » a pour objectif de présenter les outils de la génomique et de la bioinformatique dans le but de les appliquer à l’étude du génome des plantes cultivées. Les spécificités des plantes cultivées au niveau de la structure des génomes (duplications, éléments transposables, multi-génomes…) mais également du caractère hétérozygote des lignées seront présentées. Les ressources génétiques et génomiques disponibles seront présentées à la lumière de leurs applications potentielles.

La partie dédiée à l’enseignement de la bioinformatique approfondira les notions de génomique comparative, de recherche de motifs protéiques et de relation structure-fonction. Elle abordera également la notion des réseaux : réseaux de régulation et réseaux d'interactions protéine-protéine en montrant comment les construire et les analyser pour faire de l'annotation fonctionnelle. Elle se basera sur des travaux menés en TD, à partir de données (issues par exemple de séquençage NGS).

Objectifs

Comprendre les bases de la génomique appliquée aux plantes cultivées ; savoir utiliser les bases de données en bioinformatique ; comprendre les spécificités d’évolution des génomes des plantes cultivées ; connaître les processus naturels et artificiels de création de diversité génétique.

Format

Cours magistraux pour définir les concepts nouveaux. TP de manipulation d’outils de bioanalyse pour initiation à la bioinformatique. Travaux bibliographiques encadrés en vue de l’analyse des articles des restitutions. Atelier bibliographique encadré avec restitution orale et discussion.

Français
UE obligatoire
CM: 29h, TD: 21h
ECTS: 4
Lieu(x): Evry